Согласно краеведческим изысканиям с. Ильино образовано в 1648 году. В период Никоновской реформы 1650-1660 на эти земли стали переселяться раскольники-староверы, несогласные с богослужебно-обрядными нововведения. В 1648 году были построены три избы на высоком берегу реки Ирюма, проживали три брата с семьями. По указу Петра 1 в 1700 году правительство учинило раскольникам перепись, ввело две дани, в силу этого их прозвали двоеданами. Согласно этой переписи, на высоком левом берегу реки Кармак (Ирюм) стояла раскольничья деревня Ильина. В деревне насчитывалось 62 двора. Проживало в Ильиной 485 человек. Среди жителей были пришельцы из Арамашевской слободы, Багаряцкой, с. Вятки, из Каргаполья, Кунгура, Устюга. Селились в деревне раскольники и беглые.
По результатам переписи 1868-1869 гг. в Ильиной насчитывалось 342 двора, проживало 1482 человека. Из материалов государственной переписи 1893-1894 гг. в Ильиной 8 семей изготовляли до 22 тысяч штук кирпичей в год, растительное масло изготовляли 3 семьи - до 300 пудов в год. За год сапожник шил до 100 пар сапог.
В начале 20-го века в Ильино было 950 дворов, много двухэтажных домов, множество ветряных мельниц окружало село. Кроме того, была мельница-водянка на реке Ирюм, 2 масляны.
Село было богатым, крепким, но в годы советской власти, в период раскулачивания, много кулаков и зажиточных крестьян уходили из села, бросали на произвол судьбы свои добротные усадьбы. Эти дома советская власть использовала по другому назначению: под клуб, школу, ясли, сельсовет и др.. Многие дома были сломаны или разобраны, а бревна использовались при строительстве скотных дворов.
С 1923 года в стране развернулась деятельность по кооперированию сельского хозяйства. В 1929 году в Ильино прибыл первый трактор, из товариществ «Социализм», «Боевик», «Путь Ильича», «Памяти Мокина» образовался один колхоз - «Боевик», проживало в 1926 году в Ильино 2081 человек, мужчин - 989, женщин - 1092.
В 1955 году был создан Ильинский сельсовет из трёх отдельных: Ильинского, Дружининского, Саломатовского. Первым председателем сельсовета был Артём Васильевич Тимофеев.
В 1958 году создан крупный колхоз «Сибирь» в его состав наряду с 12 другими населенными пунктами, вошло село Ильино. В 1970 году образован колхоз «Имени Свердлова», в его состав вошли три комплексные бригады: Дружининская, Саломатовская, Ильинская. Председателем был Ляпунов Н.Д., с 1988 года возглавлял Топорищев Н.Е., в настоящее время председателем колхоза с 2019 года Топорищев А.Н.
В Ильино насчитывается 226 дворов, проживает 450 человек. В настоящее время большая часть села располагается на правом берегу реки, в селе 12 улиц, основная школа, магазины, столовая, отделение почты, филиал Сбербанка, д. сад.